La actividad científica del Departamento se desarrolla en líneas consolidadas como son la ecología de ecosistemas terrestres mediterráneos, las redes tróficas de sistemas acuáticos o la ecología evolutiva y global. Su producción científica destaca por los numerosos proyectos científicos competitivos en los ámbitos nacional e internacional, publicaciones recogidas en revistas de la máxima calidad en el campo de la ecología y tesis doctorales defendidas.
Los miembros del Departamento pertenecen a los Grupos de Investigación de Ecología Terrestre (RNM 220), Ecología Global (RNM 125), Ecología Funcional (RNM 020), Restauración Ecológica (RNM918) y Biología y Ecología Animal de Medios Acuáticos Lóticos (RNM 102) del Plan Andaluz de Investigación y desarrollan su actividad tanto en las instalaciones de la Facultad de Ciencias y en el Instituto del Agua de la Universidad de Granada, como en el Instituto Interuniversitario de Investigación del Sistema Tierra en Andalucía.
